岡山県窪屋郡倉敷村（現・倉敷市）の大地主で倉敷紡績（クラボウ）を営む大原孝四郎の三男として生まれる。大原家は文久年間に村の庄屋をつとめ明治の中頃には所有田畑約800町歩の大地主となった豪家である。兄が夭折したため、孫三郎が大原家の嗣子となった。